高中生赏瀑布坠崖
现在十二部
剧场版1-引爆摩天楼：★歹徒向工藤新一发出了挑战，在米花市区各地安装了炸弹，其高明的作案手法令警察百思不得其解。在柯南的缜密推理下，终于将嫌疑犯的矛头指向了具有歪曲审美意识的变态建筑师森谷帝二，并巧妙的利用线索揭露了其罪行。
★但事情并没有结束，柯南从森谷帝二口中得知，小兰将要与新一一起看午夜电影的大厦也被他埋了炸弹。小兰在柯南的指导下逐步将炸弹拆掉，但就在快成功时，却出现了设计书上所没有的红线与蓝线！随着时间一分一秒的流逝，小兰必须要尽快做出选择。到底红线还是蓝线才是新一与小兰的命运之线？电影《红线的传说》又是否会为他俩带来奇迹？
剧场版2-第14个目标：目暮警部、妃英理、阿笠博士皆无故遭到神秘人士的偷袭，而犯案现场都留下了一张诡异的扑克牌，并且受害人多少都与小五郎有点关系，这到底意味着什么？柯南从扑克中推理出犯人将根据牌中的数字进行犯罪，也就是说被害人的名字中会带有数字！那么谁又会成为下一个被狙击的目标？眼看周围的人一个个的倒下了，柯南是否会拆穿凶手的真面目呢？最终，凶手将魔手伸向了小兰，柯南是否会保护她呢？
剧场版3-世纪末的魔术师：★怪盗基德发出预告函,说要偷取俄罗斯皇室遗产“回忆之卵”.小五郎、柯南、小兰、平次、和叶被邀请到铃木财团去解读预告函并保护它。
★不料误解了基德真正的含义，结果让基德得到了。谁知螳螂捕蝉、黄鹊在后，基德却被一个专门攻击别人右眼的罪犯“史拷兵”射伤了右眼，坠海失踪……柯南夺回“回忆之卵”却惊奇发现它与设计图并不相符……
★于是柯南等人前往香阪家的城堡去探个究竟，途中小兰怀疑了柯南的身份……
★在宏伟的城堡里却不满了机关，没想到“史拷兵”也混在了队伍中，趁乱偷走了“回忆之卵”，并把枪口对准了小兰……柯南英勇的解救小兰使她又一次看到了新一的身影……
★将“史拷兵”绳之以法后，柯南回到了家中。“那时柯南好帅哦……简直就像新一一样……”看到小兰落泪的样子，柯南知道再也瞒不下去了。就在他刚要说穿身份时，新一却出现了……
剧场版4-瞳孔中的暗杀者：★两位东京警视厅的警官惨遭杀害，死时手中都握着警察手册，警视厅正对此事进行严密调查。柯南与小五郎向目暮警官询问此事，不料却被他一口回绝。在小五郎再三追问下，白鸟警官却回了一句“Need not to know”。这是警察间的暗语，也就是说此事与警察组织内部有关！
★在白鸟的妹妹的婚礼宴会上，佐藤为了保护小兰也被凶手伤成重伤，小兰因为承受不了这个巨大的打击而失忆。
★由于小兰是唯一目击凶手的证人，因此凶手也对小兰进行了一连串的追杀。此时，失忆的小兰是最脆弱的，为了能换回兰对新一的记忆，为了能将凶手绳之以法，柯南展开了行动……
剧场版5-往天国的倒数计时：★柯南一行人在露营归途中顺便去参观了日本最高的双塔摩天大楼，正巧遇上了被邀请的小五郎、兰和园子。他们在秘书的带领下参观了大楼内部。不料此时黑衣组织的成Gin和伏特加却在大楼附近……柯南的真实身份会被他们发现吗？灰原最近每天晚上又是在跟谁私下通话？而她究竟是敌还是友？
★不久，接二连三的杀人案件发生了。在目暮警部的极力劝阻下，开幕式仍然照旧进行。此时黑暗组织由于将园子误认为是Sherry而对大楼进行了狂哄滥炸，柯南面临了史上最恐怖的一次挑战……
剧场版6-贝克街的亡灵：★在东京米花市政大楼里即将举行一个将改变整个电玩世界版图的名为“茧”的虚拟游戏，此游戏集合了最先进的科技，提供5种虚拟舞台，在催眠的状态下，与具备声音辨别系统的游戏一边对话、一边游玩。柯南等人也受邀请参加发布会，并阴错阳差地混入了允许试玩茧的孩子们中。
★另一方面，此游戏的研发者坚村被害，但坚村死前留下了信息——JTR（开膛手杰克）！当游戏开始后，一个自称“诺亚方周”的人工智能控制了游戏，并宣称“如果所有人都在游戏中出局，那么你们就不会回到现实世界”，开始了一场以50条人命为赌注的游戏。
★柯南必须在19世纪伦敦的贝克街为舞台找出历史罪犯“开膛手杰克”才能使所有人得救，一场智慧与智慧的挑战即将开始，他们唯一的希望便是福尔摩斯。眼看着周围的同伴一个个的消失，柯南能救回所有人的性命吗？
剧场版7-迷宫的十字路：
★在东京、大阪和京都三地发生了杀人事件，死者都是盗贼集团源氏萤的成员，并且死者每人手中的《义经记》都被凶手夺走，这到底为了什么？接着，柯南等人由于一尊佛像被偷而受邀前往京都解谜，并在那碰到了同目的另外也寻找初恋情人的平次。
★凶手发出了挑战，寄给他们一张神秘图，说只要解开此图就能找到佛像。在此过程中，又一桩杀人案出现在他们面前，佩带老翁面具的凶手所设的陷阱一个个向他们驶来，凶手用剑术和弓箭一步步的杀向平次。终于，和叶也被他抓走了。
★面具下的神秘面孔会是什么样的？他为什么要杀死平次？水晶玉会带来什么神奇效果？前去救和叶的神秘男子究竟是谁？哀给柯南吃的药有什么效果？哀：“或许他可以恢复原来的身体”。而兰终于也见到了新一！“工藤新一，是个侦探”“新一，我终于见到你了”……平次真正能救出和叶并逮到凶手吗？平次又是否会找到他的初恋情人？
剧场版8-银翼的奇术师：
★怪盗基德再次发出了挑战壮，扬言要偷取一个名叫牧树里的女演员手中的宝石，因此树里来到毛利事务所请求小五郎的帮忙。小五郎推断基德会在树里担任主角的话剧公演最后一天盗取。于是第二天，柯南一行人便一起前往了剧团。柯南并不相信事情会如此简单，正在进行缜密的推理，正在此时，新一出现了！
★当然，这个新一绝对是基德假扮，由于基德本来就和新一很像，更本不需要易容。所以如果要拆穿他的话，惟有柯南表明身份才行。基德认准了这一点，于是很大胆的和小兰在一起。柯南一点也不敢放松对基德的警惕，就在话剧快结束时，基德消失了，柯南立即追了出去。终于在屋顶相遇，一场世纪之战即将来临，到底会鹿死谁手？
★在不久之后，飞机上又发生了命案。在这个巨大的封闭的铁鸟中，凶手究竟是如何杀人的？更糟糕的是，飞机机长也昏倒了。飞机开始失控，所有乘客危在旦夕……柯南面临了史上最大的挑战，他是否能化险为夷、救回众人的性命呢？而此时，小兰也终于表白了：“我喜欢你啊，新一”……
剧场版9-水平线上的阴谋：★15年前在北大西洋上的一个夜晚，一艘名为“第一八代丸”轮船不幸撞上了冰山，沉没到海中。不过船上大部分人已经脱离危险，只有船长和一名高级干部身亡。15年后的东京西多摩市的别墅密集区，八代造船设计师八代英人开车时坠崖身亡。到底这相隔15年并且发生在海洋和陆地上的两起事故，到底会有什么样的阴谋？
★柯南、兰、小五郎和少年侦探团受到园子邀请参加了豪华客轮阿芙洛迪特号的航行……然而没过多久，园子便在玩捉迷藏中失踪了，幸好被柯南找了回来。但是事情并没有结束，八代客轮的董事长八代贵江在房中被杀，其父八代延太郎也在船上失踪……获悉此事的目暮警官带着他的助手来到了船上调查此事，同时陆地上的案件也有人在调查。当然，柯南也展开了自己的推理，但是这次的嫌疑人高达600人之多……
★经过柯南的努力，终于找到了凶手，就在要揭发他的时候，客轮的机房却发生了爆炸！客轮此时摇摇晃晃，乘客们非常危险，大家陷入了极度的慌乱中。更糟糕的是，兰也卷入了事件当中，生命岌岌可危！柯南是否会惩治真凶，解救小兰呢？
剧场版10-侦探们的镇魂歌：
★受了委托人的邀请，柯南、小五郎、兰和少年侦探团们前去横滨赴约。但万没想到的是，他们都中了幕后主导的圈套，戴上了名曰“奇迹乐园的自由通行ID”类似手表状的东西，实际上是个炸弹——如果柯南和小五郎不在12个小时内解决事件，他们就会被炸死，而且走出游乐园的话也会被炸死！
★而关西名侦探服部平次也卷入了这次事件中，与他们同命相连的还有白马探，怪盗基德也会在电影中华丽的登场。众多明星联袂出演，***同解决棘手案件。柯南是否会及时救出兰等相关人吗？
★更让人吃惊的是，幕后主谋竟然知道柯南就是工藤新一！——“是工藤吧。高中生侦探工藤新一”！难道主谋的身份是……
剧场版11-绀碧之棺：太平洋上的美丽小岛——神海岛。传说在很久以前，那里的海底就存在着古代遗迹“海底宫殿”，并且300年前真实存在过的两名女海盗“安娜·波尼”和“玛丽·里德”曾在那里遗留了大量的宝藏。到神海岛度假游玩的柯南一行人遇到了一群来寻找财宝的探险人。他们中间笼罩着一种非常诡异的气氛。不久，其中一人被鲨鱼袭击死亡，引出了一连串的杀人事件，为了探求真相，柯南和灰原一起展开了调查。
剧场版12-战栗的乐章：发生了专杀音乐家的连续杀人事件。被杀的人都出自一位有名的钢琴家领导的音乐学院。柯南一行人受邀参加了由他制作的某音乐厅落成公演。这次公演的亮点就是据说曾被巴赫弹过的管风琴和世界著名的小提琴“斯特拉迪瓦里”的音色。还有据说拥有无与伦比音感的天才歌手的表演。可是，在即将正式公演的时候，开始发生了种种可疑的事件。接着在演出当日，柯南他们到场的音乐会会场突然发生了爆炸。全场顿时被火海包围……