我妻由乃最后和男主在一起了吗

该人物最后没有跟男主在一起。

根据漫岛查询得知，我妻由乃与男主虽然有着深厚的感情，但最终并没有走到一起。在动漫《未来日记》中，由于由乃对男主的爱意扭曲，加上由乃的病娇属性，使得由乃与男主的关系充满了矛盾和冲突。虽然由乃曾多次试图改变男主的命运，但由乃最终意识到自己的行为只会给周围的人带来痛苦。

在结局中，由乃为了保护男主和其他人，选择了自我牺牲。虽然由乃没有和男主在一起，但由乃的爱和牺牲却深深地影响了男主，成为了男主成长的重要力量。