动力机甲电影
图为第二部分。
影片讲述了一个年轻的黑客Neo发现看似正常的现实世界实际上被一个名为Matrix的计算机人工智能系统所控制。在神秘女孩崔妮蒂的指引下，尼奥认识了黑客组织的首领莫斐斯，三人踏上了对抗黑客帝国的征程。
第一部分
尼奥(基努·里维斯)，一个生活在黑客帝国的年轻黑客，发现似乎
矩阵(2)
正常的现实世界实际上似乎被某种力量所控制，于是Neo在网上调查了此事。而生活在现实中的人类抵抗组织队长劳伦斯·菲什伯恩一直在寻找母体中传说中的救世主，于是在人类抵抗组织成员三位一体(凯莉·安妮·莫斯饰)的指引下，两人相遇，尼奥也在墨菲斯的指引下回到了现实中，逃离了母体。他这才意识到自己一直生活在虚拟世界里，真实的历史是20XX年，人类发明了AI(人工智能)，然后机器人叛变，和人类爆发战争，人类节节败退。在不得已的情况下，整个天空都被乌云笼罩，以切断机器人的能量(太阳能)。谁知机器人研发出了一种新的能源——生物能，就是利用基因工程人工制造人类，然后连接到母体中，让他们在虚拟世界中生存以获取多余的能量。知道这些后，尼奥加入了人类抵抗组织。在莫斐斯的训练下，他逐渐成为一名强大的“黑客”，并逐渐显露出与其他黑客的不同，这让莫斐斯更加确定自己就是救世主。这时，人类抵抗组织中出现了叛徒，墨菲斯被捕，尼奥救出了墨菲斯，但在逃跑的过程中，却被《黑客帝国》的“杀毒软件”特工杀死。结果，吉尼奥德反而获得了新的权力。复活后的Neo对自己的“救世主”身份毫不怀疑，意识到自己可以改写母体中的程序。他立刻入侵了特勤局的一个程序——史密斯，让史密斯消失得无影无踪，其他特勤局程序闻风而逃。
从此，人类与机械的战争进入了一个新的时代，后续剧情在《黑客帝国2:重装上阵》中继续发展。[1]
第二部分
上次说Neo终于意识到自己的能力和使命了。当他被枪毙“复活”后，也成了无所不能的“救世主”。结尾的“翱翔”象征着人类超级英雄的诞生:Neo将带领锡安基地的人们向机器世界发起反攻，并将作为胜利者结束战斗，让人类回归自由。他的使命会实现吗？母体会这么愿意被毁灭吗？
整个“重装”其实就是Neo探索任务背后真相的过程，他想为自己的行为找到一个可以接受的理由。在最后一集击败特工史密斯并救出墨菲斯后，尼奥和他的亲密爱人崔妮蒂以及其他战友一起，乘坐“尼布甲尼撒号”宇宙飞船回到了锡安基地，地球上最后一个人类据点。在那里，他们和其他自由战士聚集在一起，包括莫斐斯的死敌内奥比·梅梅。此外，基地的政客们也上台了。
这时，母系统决定“先发制人”，出动25万电子乌贼的军队，开始攻击锡安基地。薄弱的基地防御力量不足以对抗如此强大的机甲兵团。看来人类最后的香火也岌岌可危；莫斐斯，他们的飞船上当然有各种资料，自然少不了中国的电子版《左传》《史记》等古籍。尼奥曾经想出一个“围魏救赵”的好办法，决定再次潜入母体，从内部摧毁它，最终达到消灭机甲兵团的目的。与此同时，尼欧也想再次与先知对话，以进一步了解他的神圣使命。
然而，“向母神学习”的道路注定是危险的:在寻找母神系统中唯一知道系统弱点的“关键制造者”的过程中，尼奥、墨菲斯和三一遇到了前所未有的困难:敌人的能力升级了，数量增加了，尼奥的超能力受到了致命的挑战，墨菲斯和三一对尼奥的信心也受到了无情的事实打击。但在一切的源头，Neo所了解到的，是撼动了之前所有认知的真相。[2]
第三部分
矩阵革命
《黑客帝国》系列的最后一集，延续了《黑客帝国2:重装上阵》的剧情，揭示了机器和人类的终极命运。
面对电子乌贼的大潮，人类城市危在旦夕，莫斐斯和三一欲与入侵者决一死战。此时，“救世主”尼奥的身体和心灵意外分离，后者再次陷入“母体”。莫斐斯和崔妮蒂也不得不回到“母亲”身边，和守护天使一起寻找他。
锡安的局势越来越危险，但机器的攻击并没有因为人类的抵抗而减弱。此时，被叛徒射瞎的尼奥仍想通过希望实现自己的预言。此时，特工史密斯控制了先知，并且变得越来越强大，威胁着整个“矩阵”的稳定。在返回锡安的途中，飞船被电子乌贼突袭，三位一体死亡，重伤的尼奥来到机器城。
虽然在重重阻碍中，尼欧不顾世界，通过救世主的超能力成功进入机械城，但三一却死在了这里。尼奥进入机器城后，与母体的创造者(其地位相当于诺斯替中的神，详见“减轻二元论”)达成停战协议。
代价是尼奥必须进入母体，删除史密斯，一个强大的叛逃变节的病毒。经过一番苦战，Neo败下阵来，被史密斯感染复制，但造物主也获得了史密斯的代码，从而成功将其清除，在最后一刻拯救了仅存的人类和被机器人大军彻底毁灭的锡安。机器世界和现实世界相安无事，人类从此可以选择生活在母体或者现实世界，造物主也承诺不愿意生活在机器世界的人(母亲)将获得自由。最后，先知暗示救世主会回来。
在与机器的谈判中，为了人类和机器的共同利益，机器承诺尼奥会毁灭史密斯，机器不会毁灭锡安。人类迎来了新的和平。[