现在还有动物防疫部门吗

有。动物防疫监督机构为两个单位，均属于农业农村部门管辖的事业单位，有动物防疫部门，分别是动物疫病预防与控制中心和动物卫生监督所。中国动物疫病预防控中心成立于2006年，是农业部直属事业单位。