国际空间站的安全事故
利弊争议
有很多对NASA持批评观点的人认为国际空间站计划是在浪费时间和金钱，并且抑制了其他更有意义的计划。持有这种观点的人列举，花费在国际空间站计划上的上千亿美元和近乎一代人的时间，可以用来实施无数的无人太空任务，或者将这些时间和金钱花在地球上的研究中，也要比国际空间站更有意义。
空间站的支持者认为对于空间站的批评是目光短浅而且带有欺骗性的，支持者认为花费在载人空间探索上的巨额经费同样会给地球上的每个人带来切实的好处。有评估指出，国际空间站计划所开发的载人航天相关技术的商业应用，会间接带动全球经济，其所带来的收益是最初投资的七倍，也有一些相对保守的估计则认为此种收益只是最初投资的三倍。还有一些坚定的支持者认为，即便国际空间站在科学方面的意义为零，仅其发挥的推动国际合作的作用，也足以令这个计划彪炳史册。
躲避垃圾
2012年9月26日美国宇航局（NASA）表示，一个俄罗斯废弃卫星的碎片和一艘印度火箭的残骸27日将飞近国际空间站，存在撞击空间站的可能。若有必要，国际空间站27日可能会做出移动。
国际空间站内三名航天员会借助对接在空间站上的欧洲补给宇宙飞船的动力来移动空间站。欧洲宇宙飞船本来应该已经离开，因为通讯故障，返航时间才被延误。
2015年7月16日，国际空间站险遭太空垃圾（俄罗斯一颗气象卫星的残片）袭击。当时飞来的碎片离国际空间站只有3千米，三名宇航员被迫只能用半小时的时间躲进逃生舱，暂时停留在太空站附近的“联盟号”宇宙飞船内避难，宇航员需要花一个多小时才能返回国际空间站重新开始工作。这已是国际空间站建立16年来第四次发生类似的事件。据悉，国际空间站所在的轨道上有2.2万块由废弃卫星、火箭残骸、航天器爆炸和相撞过程中产生的碎片。这些碎片的直径至少有10厘米，飞行速度为每小时28160千米，会给轨道中运行的飞行器带来安全威胁。
退役之争
国际空间站的命运在成为一个新的讨论话题。因为稍早些时候，俄罗斯航天署副署长维塔利·维多夫在电视节目中宣称，国际空间站将于8年后即2020年坠入太平洋，结束自身使命。他同时表示，之所以选择坠毁的方式，是由于国际空间站结构太复杂，体积也太大，如果滞留在太空，将会成为一堆颇具威胁的太空垃圾。
然而，据美国国家地理杂志在线版刊发的文章称，俄航天署所作之结论并没有得到各方的赞同。美国国家航空航天局（NASA）拿出很多支持的论调，意图佐证国际空间站的使用寿命很有可能将超过2020年，因为俄罗斯方面所谓2020年坠落的判断并不符合现实情况。
据美国国家地理在线文章称，空间站的坠落将逃不出地面控制的手掌心。单就美国掌握的技术水平而言，已经有能力在低地球轨道（高于地球表面数百公里）上同时跟踪8000个篮球大甚至更大的物体，其中多数是废弃的火箭和人造卫星，包括500多个航天器残骸。因而抓住一个空间站，并不能构成挑战。
欧空局和另外一些参与国也断然不会轻易放弃使用权，而是想方设法地继续让这个基站停留太空中。NASA发言人凯利·汉弗莱斯还暗示，其他多个国际空间站参与国家的负责人已经就空间站的使用问题达成一致，各方正在努力确保其寿命能够延长到2028年以后。
2014年1月，美国国家航空航天局获得白宫支持，将国际空间站的使用期再延长4年到2024年。
首位英籍宇航员
欧洲航天局20日宣布，英国人蒂姆·皮克将于2015年作为首位英籍宇航员进入国际空间站执行任务。
冷却失灵
2013年12月12日，国际空间站在发现阀门问题导致冷却系统发生故障后，国际空间站于11日关闭许多功能。空间站中的6名宇航员安全无恙。
美国宇航局发言人乔希·拜尔利证实称，空间站两套冷却系统中的一套发生故障，宇航员没有危险。为了减少温度控制设备压力，空间站中许多系统已被关闭，生命维持系统、电力系统以及科学实验设备则与另一套完好冷却系统相连。
宇航员们在冷却系统故障后努力恢复冷却系统压力，确保关键系统维持正常温度。这主要取决于空间站处于阳光照射下还是地球阴影中。发生故障的冷却回路系统产生太多氨水，达到预设温度最高极限而被关闭。宇航员们怀疑冷却泵中流量控制阀出现问题。
2013年5月，国际空间站曾发生冷却剂泄漏问题，2名宇航员曾进行太空行走进行修复。发生故障时空间站上有3名美国宇航员、2名俄罗斯宇航员、1名日本宇航员，他们的驻留期到2014年3月结束。
病毒感染
北京时间2013年11月12日早间消息，俄罗斯著名安全专家尤金·卡巴斯基披露，一名俄罗斯宇航员携带的优盘已经导致国际空间站感染病毒，除此之外，臭名昭著的“震网”病毒也已经感染了俄罗斯的一座核电厂。
卡巴斯基并未披露国际空间站因为病毒感染所受到的具体影响，也没有透露受感染的日期。但外界猜测，有可能是在联合太空联盟2013年5月对国际空间站进行维护时发生的。他们当时将整个系统都更换成了Linux，使之更加“稳定而可靠”。
在此之前，国际空间站上有“数十台笔记本”使用的是Windows XP，该系统比Linux更容易感染恶意软件。
卡巴斯基表示，感染事件最初发生在科学家们使用的Windows笔记本上，后来由优盘携带到国际空间站。但在2013年5月更换成Linux前，国际空间站的控制系统就已经采用了各种版本的Linux。
据科技网站ExtremeTech报道，早在2008年，俄罗斯宇航员就携带一台被W32.Gammima. AG蠕虫感染的Windows XP笔记本前往国际空间站，并很快感染了空间站内的其他Windows XP笔记本电脑。
卡巴斯基表示，这一事件表明，不接入互联网也不能让你逃避被病毒感染的风险。在另外一起事件中，一家未接入互联网的俄罗斯核电厂同样被感染了臭名昭著的“震网”病毒。
虽然并未对主流用户产生太大影响，但“震网”已经成为有史以来最臭名昭著的病毒之一。虽然美国和以色列政府从未承认，但外界普遍认为，“震网”是这两国政府联手开发的，目的是破坏伊朗核设施，阻止该国开发核武器。
由于伊朗纳坦兹核反应堆也没有接入互联网，所以该病毒同样是通过优盘传播的。它可以令离心机的旋转失去控制，导致工厂出现物理损坏。
卡巴斯基表示，震网、高斯、火焰和红色十月等病毒都极其复杂，开发成本高达1000万美元。
据俄罗斯地面飞行控制中心表示，2014年5月13日载人飞船“联盟TMA-11M”号返回舱在哈萨克斯坦预定地点附近着陆，乘坐它从国际空间站返回地球的有：俄罗斯宇航员米哈伊尔·秋林、日本宇宙航空研究开发机构（JAXA）宇航员若田光一和美国宇航员里克·马斯特拉基奥。
下一期考察组成员5月28日将抵达国际空间站，在此之前俄罗斯宇航员亚历山大·斯科沃尔佐夫、奥列格·阿尔捷米耶夫和美国人史蒂文·斯旺森继续留在空间站工作。
外壳附浮游生物
据俄媒20日报道，俄罗斯科学家称，他们在对取自国际空间站窗户和墙壁的样本进行分析时发现，国际空间站的外壳上竟然附着着海洋浮游生物。不过科学家称，目前尚不清楚这些浮游生物如何进入太空的。
报道称，国际空间站俄罗斯任务组负责人拉基米尔 索洛夫耶夫(Vladimir Solovyev)称，近期的研究证明，一些生物能够在国际空间站的外壳上生存。
索洛夫耶夫还称，一些研究甚至认为，这些生物能够在真空、低温、辐射等恶劣的航天条件下生长。
索洛夫耶夫表示，这一实验得出的结果非常独特，科学家们在国际空间站的表面上找到了浮游生物的痕迹，这将成为进一步研究的课题。不过他指出，目前尚不清相互这些浮游生物是如何进入太空的。
科学家称，实验中发现的浮游生物可以在海洋中找到，但在国际空间站宇航员和货物的升空地点、位于哈萨克斯坦的拜科努尔发射场却不常见。
氨气泄漏事故
2015年1月14日，美国宇航局证实国际空间站上发生氨气泄漏事故。目前空间站上的宇航员安全，正在拟定解决问题的计划。
氨气泄漏发生在国际空间站的美国部分，有毒物质从冷却系统进入了空间站的空气中。宇航员已经疏散到了俄罗斯区域，人员安全。受污染的单元已经被封锁，空气污染物的水平在可接受范围之内，人员暂时没有进一步疏散到“联盟号”上的必要。
俄罗斯任务控制中心的负责人称，进一步的措施需要由位于美国休斯敦的美方控制中心拟定计划 。