吴敦义的家庭成员

父：吴奚，曾任台湾光复后南投县第1届农会干事、第1届县议员，“2.28事件”受难者。

妻：蔡令怡，曾任“中华妇女联合会”高雄分会理事长。育有2子2女。

长子：吴子廉现为吴敦义“国会”助理，媳曾淳芬为会计师；次子吴子文；女吴子安，女婿林泰成为医师。