百万小学堂的游戏环节
游戏开始，会有一大人参赛者从制作单位指定的入通道入场，主持人介绍完大人参赛者，以及观看大人参赛者于小时候之照片之后，到指定答题桌上开始游戏。如大人参赛者没有照片，或曾参赛，此部分通常省略。
大人参赛者再从五名小学生智囊团之中，选择一位作为“陪考生”。第十一集之前，大人参赛者可以携带一名协助答题的小朋友，当作“陪考团”的成员，由“一名非资优生、四名资优生”的组合阵容，以协助参赛者过关；第十二集之后，大人参赛者均只能有“五位资优生”的组合阵容，以协助参赛者过关（除第三十五集，陶大伟与孙越的部分以外）。
当大人参赛者选定智囊团陪考生后，陪考生从指定座位离席到考桌位置，并与大人参赛者进行击掌动作，大人参赛者即可开始进行游戏。不同的陪考生，须均得与大人参赛者有各有至少一次的击掌动作。同预防H1N1的政策，第三十三集至第三十七集期间，与第五十一集之后的节目，都不作击掌动作。前者的智囊团陪考生，改以鞠躬方式向参赛者问好；后者的智囊团陪考生，改用拱手的方式向参赛者问好。 大人参赛者可以从十大类型（最高奖金题目必须为第十题）中，挑选一个题型。第四集之前，大人参赛者可以询问小学生参赛者擅长的范围，以作为过关斩将的根据； 但在第五集之后，制作人以“不可让小学生‘掌握生杀大权’”为由，大人参赛者不可询问小学生参赛者擅长范围。
十大题型分类如下：
国语（包括文字字型、古典文学、现代文学、笔划、部首次序…等）
数学（包括代数学、几何学、机率、统计学…等）
自然与生活科技（生物、物理、化学、地质学、大气学、天文学…等）
健康与体育（健康教育、体育、身心发展、中西医学、人体学…等）
生活
英语
社会
艺术与人文（包括音乐欣赏、国内外艺术品与古物欣赏、人文活动、等）
综合活动（包括辅导活动、团体活动、童军教育、卡通动画、户外教学…等杂项）
乡土语言（方言、地方歌谣…等）
电脑或资讯类别问题（极少出）
每组题库从国小一年级至国小六年级均有，但科目类型并非全部从一年级至六年级均有，例如自然与生活科技，必定是从三年级开始，至六年级为止。而题目固定的数量，为一、二及三年级各一题、四、五及六年级各二题，并加上十万挑战题一题（必须为第十题）。
下列为科目的级别数分布：
生活：一年级至二年级。
综合活动：一至六年级均有。
国语：一年级至六年级。
数学：一年级至六年级。
自然与生活科技：三年级至六年级。
社会：三年级至六年级。
乡土：二年级至六年级。
健康与体育：一年级至六年级。
艺术与人文：三年级至六年级。
电脑：五年级至六年级，但极少出现。
而每组题库的题目类型，会是是非题（True or False）、三选一选择题（One Choice from Three）或是问答题（Question and Answer）的其中之一，但第十题（十万挑战题）的题型必定为问答题。 当旁白把题目读完时，“陪考”小学生参赛者可以随时作答。无论是“陪考”小学生参赛者或大人参赛者，左手边均有一个按钮，有答案者，无论对错，均须按下此钮，表示“作答完成”并“锁定答案”（answer locked）。当小学生参赛者用光笔把答案写在书写板上，制作单位均会把答案事先存盘好，以供大人参赛者使用“锦囊”时，秀出给大人参赛者观看。
大人参赛者每次答完两道题目（于第二、第四、第六、第八题答完）时，则从五位小学生参赛者，再选择一位进行“陪考”。在一回合之中，选择过的小学生参赛者不能再陪考，意即不同参赛者只能于偶数次时，各次选择不同之陪考生。若参赛者于第九题答题时仍有锦囊，小学生参赛者只能陪考一题（因参赛者回答第十题时，不可使用锦囊）。 下列是每一位大人参赛者所能获得的奖金的摇钱树。
第一题答对：1,000元
第二题答对：3,000元
第三题答对：5,000元
第四题答对：8,000元
第五题答对：12,000元
第六题答对：24,000元
第七题答对：36,000元
第八题答对：48,000元
第九题答对：60,000元
第十题答对：100,000元
但如果参赛者在回答该问题的奖金上失败，则累计奖金折半。例如参赛者在第九题答题失败，则第八题的累计奖金48,000将折半至24,000元。第一题挫败者无奖金。
下表为挫败奖金列表。
第一题答错（没有答对题目）：0元
第二题答错（答对一题）：500元
第三题答错（答对二题）：1,500元
第四题答错（答对三题）：2,500元
第五题答错（答对四题）：4,000元
第六题答错（答对五题）：6,000元
第七题答错（答对六题）：12,000元
第八题答错（答对七题）：18,000元
第九题答错（答对八题）：24,000元
第十题答错（答对九题）：30,000元 第九集之后的观众入场前，制作单位均会要求在每次大人参赛者答完题目要准备按钮，或者是说出答案（无论对错）的同时，都要发出“欸”的声音，让大人参赛者感到恐慌而不知所措，这也是该节目的特点，制作单位亦称这是“精华所在”。
除了大部分是非题的题型外，大人参赛者在答错题目后，主持人会开放现场观众答题（制作单位有开放观众参观录影），答对的现场观众，可获得制作单位准备的小礼物。
下列是此节目曾经发送给答对题目的观众的奖品。
MP4播放器壹台；
“会说话的巧克力”礼盒一份；
《百万小学堂》相关题目丛书一本；
六度空间电影票；
几米的拼图礼盒；
怀旧系列拼图；
变形金刚玩具模型；
书包厂商提供的手提袋；
其他如大人参赛者提供的赠品，如阿本于宣传《萌学园》的乐园活动时，就将其保温杯作为他落败时给答对题目的小朋友的赠品。
而现场答题观众，是不用其他观众***同喊“欸”的，答题观众的答案对错，直接由幕后工作人员告知。 为了使大人参赛者能够过关斩将，制作单位提供了三个锦囊（又称“作弊方式”，在第一百七十八集出现四个）供大人参赛者于答题时使用。只要大人参赛者抽出一张放置在参赛者前面的卡，表示大人参赛者“使用”了该锦囊。
锦囊的名称与用途如下：
好人卡（peek，水蓝色卡）
“好人卡”的名称，源自恶搞文化的“好人”一词，有“同学借我看”的功能，可以偷窥并参考小学生参赛者的答案，但不一定要完全一样，胜败必须由大人全权承担。故如果小学生参赛者写对答案，但大人参赛者却不采信其答案，则大人参赛者失败。
同学卡（copy，紫红色卡）
“同学卡”有“同学你罩我”的功能，这是一项完全照抄小学生参赛者答案的方法，但使用此方法，则必须是与小学生参赛者的答案完全一样，故大人参赛者的成与败，全部交给小学生。故如果小学生参赛者答错，大人参赛者也失败。 第三个锦囊，仅在于名称有显著的不同，但两者功能是大同小异的。下列叙述此二种不同锦囊的特点。
团结卡（save，土黄色卡）
“团结卡”有“四人帮帮我”的功能，由陪考生之外的另外四名小学生参赛者写出答案。要是这四个小学生内，有一个的答案是标准答案，大人参赛者就算答对；反之没有人写对者，大人参赛者闯关失败。此卡若用于选择或是非，则过关胜算较大。
知识卡（knowledge，土黄色卡）
“知识卡”的名称，源自Yahoo!知识+，有“知识力量大”（Knowledge is power）的功能。由未上场的四个小学生，透过Yahoo!知识替参赛者找寻答案，功能较“团结卡”更好。因此，“知识卡”不像“团结卡”无法上网找寻资料，只能借助小学生参赛者累积的知识作答，其余的功能，都与“团结卡”一样。一集节目最初的大人参赛者使用知识卡时，旁白会有下列的台词：小学生的知识，除了来自课堂上老师教授的内容，还有一部分是上网搜寻、自我充实的成果噢！
使用知识卡，知识力量大！
第四个锦囊：
小虾卡（little shrimp，深绿色卡）
第一百七十八集开始出现。使用的时机，是必须在不是其他五位小学生智囊团的其中一位帮助参赛者答题前，或者是三张基本卡（“好人”、“同学”，以及“团结”卡）都用光时，无论是答题前或答题后，均可使用。大人参赛者使用时，可参考班长小虾的答案，取信或不取信其答案。因此，若小虾答错答案，而大人参赛者取信答案，则大人参赛者失败；或说若小虾答对答案，但大人参赛者不取信其答案，则大人参赛者也失败。
爸爸卡（daddy，土黄色卡）
陶喆的“专用卡”，于第五十集出现，是制作单位特别为陶喆“量身订做”的卡片。陶喆可以将好人卡、同学卡，以及团结卡其中一张，换成“爸爸卡”。陶喆要是遇到不会的问题，可以使用此卡，拨打电话给爸爸陶大伟，并且相信或不相信爸爸的答案。顺带一提，张小燕透过电话，将以前陶大伟不给酸梅的事情一笔勾销，并且张小燕也告诉了陶喆给爸爸礼物的建议。
老公卡（my husband，蓝色卡）
杨帆之妻Julie（本名：刘景庄）的“专用卡”，于第一百六十一集出现，同样也是制作单位特别为Julie“量身订做”的卡片。Julie可以将好人卡、同学卡，以及团结卡其中一张，换成“老公卡”。Julie要是遇到不会的问题，可以使用此卡，拨打电话给杨帆，并且相信或不相信其答案。顺带一提，Julie在不知道第二题“一年级生活：著名动画《蓝色小精灵》，源自于哪个国家？”的题目中，使用了此卡。虽然老公的建议答案是A. 奥地利，Julie不采信其答案，改答C. 西班牙，结果答案是B. 比利时而落败，仅得五百元的奖金。但大人参赛者在游戏时，将所有锦囊都用完，后续进展如下：
第一集时，陪考小学生的答案则不能再提供给参赛者，尚未上场的四名小学生亦同；但每次作答时，陪考小学生与其余四位未上场的小学生参赛者仍然得继续作答，直至参赛者挫败为止。主持人视情形，会适时地公布小学生参赛者们的答案（当然，大人参赛者在此时就是锁定答案了）。
第二集之后，大人参赛者身旁无陪考小学生，小学生参赛者也不用继续作答，更无每二题换人的进度。