如何预测和鉴定mirna的靶基因

现在有一些预测miRNA靶基因的算法和网站，免费的，例如miRtarget等，网上一搜一大把。可以用它们去预测。

但这些算法常常不是很靠谱，因此应多几种算法综合考虑。但这样仍然不是特别靠谱。

实验筛查的方法目前最有效的是转录组+翻译组测序。其中翻译组测序是中国暨南大学的张弓教授首创的，中国在这个领域上目前还是世界领先的，被作为人类蛋白质组计划的四大支柱之一。

在动物中，miRNA的作用原理是不完美匹配mRNA的3'-UTR，通过抑制翻译起始来调控基因表达。据此可以设计，你过表达这个miRNA，那么它的靶基因应该是mRNA不怎么变，但翻译中mRNA明显下调。符合这一特征的即很有可能是miRNA的直接靶点。再结合软件判断，一般就可以很精准了。