翁启惠的学术荣誉

1986—1991年，年轻领袖研究发现奖，美国总统杰出青年化学奖〈Presidential Young Investigator in Chemistry〉。

1993年，美国化学协会Arthur C. Cope学术人员奖〈American Chemical Society A. C. Cope Scholar Award〉。

1994年，获选为“中央研究院”第二十届院士〈Academician, Academia Sinica, R. O. C.〉，国际碳水化合物奖〈The IUPAC International Carbohydrate Award〉。

1995年，Carbohydrate Division Wolfram Award

1996年，获选为美国人文与科学学院会员〈Fellow, American Academy of Arts and Science〉。

1998年，Harrison Howe Award in Chemistry

1999年，Claude Hudson Award in Carbohydrate Chemistry，

2000年，国际酵素工程奖〈The International Enzyme Engineering Award〉，美国总统绿色化学奖〈The Presidential Green Chemistry Award〉

2002年4月30日，获选为美国国家科学院院士（Member, The US National Academy of Sciences）。

2005年，American Chemical Society Award for Creative Work in Synthetic Organic Chemistry

2006年5月，被选为新一任“中央研究院院长”。

2014年1月，获得沃尔夫化学奖(Wolf Prize in Chemistry)。