限制性片段分析需要用什么方法
1.PCR扩增:PCR反应体系为20μl,含模板2μl(约50ng),引物各1.6μl,dNTP1.6μl(0.4mM),10×Buffer缓冲液2μl,Taq酶0.5U,加双蒸水至20.0μl;PCR反应条件为95℃2min,94℃30sec/64℃30sec/72℃30sec(5个循环),94℃30sec/63℃30sec/72℃30sec(5个循环),94℃30sec/60℃30sec/72℃25sec(23个循环),94℃30sec/60℃30sec/72℃1min。
2.PCR 扩增产物的检测:取PCR 扩增产物2μl,以1%的琼脂糖凝胶潜水电泳法检测靶DNA 片段的扩增产物。
3.酶消化反应:取PCR 产物约2.0μl,加限制性内切酶BstN I1U,10×酶消化反应缓冲液1.0μl,蒸溜水补至10.0μl 置试验管中。37℃温箱中孵育4h。
4.酶切产物电泳分型:6%聚丙烯酰胺凝胶电泳(T=6%,C=3.3%,凝胶规格为82mm×64mm×0.75mm)。电极缓冲液为1×TBE。将加有1/5 体积上样缓冲液的酶切产物电泳,220 v 电压,电泳2-3h。
5.银染显色将凝胶剥离至染色盘中,用10%冰醋酸固定30min,去除固定液,用蒸馏水冲洗凝胶3 次(2min 以内)。将0.1%硝酸银溶液200ml 倒入染色盘中,染色30min,倒掉染色液,蒸馏水快速冲洗凝胶1 次(20s 以内)。显色液200ml(3% Na2CO3,含0.05%甲醛,2‰Na2S2O3)倒入染色盘中,不断震荡,直至谱带显示清晰。用固定液终止显色。蒸馏水洗涤一次,贴于滤纸上晾干保存。