链终止法测序dna的基本过程?

链终止法测序(Sanger测序)是一种常用的DNA测序方法,以下是其基本过程:

DNA模板准备:首先,需要获得待测序的DNA样本并纯化。通常使用PCR或细菌培养等方法扩增DNA片段,以获取足够的模板。然后,通过热变性使得DNA变成单链。

标记引物合成:在DNA模板的末端,使用DNA聚合酶和二进制核苷酸(ddNTPs)进行DNA合成。其中,ddNTPs是普通二进制核苷酸(dNTPs)的缺氧衍生物,与dNTPs类似,但它们在3'-OH末端没有3'-OH上的羟基,因此会使DNA链延伸终止。

反应分割:将合成的DNA片段通过凝胶电泳分离。DNA片段根据长度进行分离,并根据终止碱基类型(ddATP、ddCTP、ddGTP和ddTTP)的不同而产生颜色差异。

凝胶电泳:将反应产物注入聚丙烯酰胺凝胶,然后通过施加电场使DNA片段沿凝胶移动。由于凝胶中的孔隙大小不同,较短的DNA片段移动得更快,而较长的片段移动得更慢。

电泳结果分析:通过适当的检测方法,如荧光标记或放射标记,观察凝胶中DNA片段的分布情况。不同的碱基会产生不同的颜色或放射强度,因此可以确定DNA序列。

数据分析:通过分析凝胶电泳图像上的带状图案,可以确定DNA片段的顺序和长度。根据带的相对位置和颜色,可以推断DNA的碱基顺序。

链终止法测序是通过使用复制DNA链时终止碱基的特性,结合凝胶电泳技术,来确定DNA序列的一种方法。